первой половине 1840-х годов над местом захоронения епископа Иакова, мощи которого покоятся под спудом в северо-восточном углу собора Зачатия св. Анны, вместо старой деревянной гробницы была устроена новая серебряная рака. Инициатором ее сооружения являлся архимандрит Иннокентий, незадолго до того построивший в монастыре храм, освященный в честь св. Иакова Ростовского. Деньги, необходимые для изготовления раки были собраны путем пожертвований. Основные средства, более половины требуемой суммы, в 1839 году внесла графиня Анна Алексеевна Орлова-Чесменская, которая перед этим финансировала строительство в обители Яковлевской церкви.

Изготовление гробницы св. Иакова было поручено известному московскому серебрянику Ивану Матвеевичу Лаврову, контракт с которым был подписан в Ростове в феврале 1843 года. Стоимость гробницы, весившей 126 кг (7 пудов 28 фунтов 2 золотника) составила 9300 рублей. Несмотря некоторую на задержку с выполнением заказа, работа Лаврова получила в монастыре высокую оценку. Архимандрит Иннокентий исходатайствовал для мастера благословение от Синода «за превосходнейшее устроение» серебряной раки.

В своем доношении в Синод от 13 декабря 1844 года настоятель сообщал, что «мастер купец Иван Лавров по добросовестности своей, устроил вышеозначенную гробницу св. Иакову столько тщательно, изячно и отчетливо во всех отношениях, что московская публика всех сословий и все знатоки сего художества, наслышанныя об отличных талантах вновь прославившагося мастера, по отделке и открытии ея, непрерывно во множестве стекались в продолжение 10-ти дней в дом его, чтоб видеть превосходство и изячность отделки оной, и отдавая полную и справедливую похвалу мастеру, все единогласно утверждали, что это есть единственное сего рода в отечестве нашем произведение».

В Спасо-Яковлевском монастыре новая гробница основателя обители была установлена над местом погребения епископа Иакова − в проеме арки, соединяющей Зачатиевский собор и вновь сооруженный Иаковлевский храм. В декабре 1844 г. она была торжественна освящена.

Серебряная гробница св. Иакова была уничтожена при изъятии церковных ценностей из Спасо-Яковлевского монастыря в 1922 г.

«На северной стороне храма [Зачатия св. Анны], в разстоянии 4 аршин от алтарных врат и 1½ аршина от стены, находится гробница св. Иакова Епископа Ростовскаго. Здесь, под спудом, почивают мощи его. При начальном устройстве церкви Митрополитом Ионою над гробницею Святителя складена была каменная сень, но в 1779 году она разобрана и вместо ея поставлена резная, деревянная, четырехугольной формы, утверждена на четырех выгнутых столбах и покрыта червонным золотом. На правой стороне сени вырезаны: Евангелие, крест, митра, трикирии, по углам Ангелы, а наверху воздвигнуто распятие.

Рака над мощами Святителя прежде была деревянная, позолоченная; но в 1845 году, тщанием архимандрита Иннокентия и усердием Гр. А.А. Орловой Чесменской устроена кованая, серебряная, весом 7 п. 28 ф., ценою в 9276 р. сер.; она имеет вид продолговатаго четырехугольника; поверх ея на кипарисной доске, обложенной серебряным чеканным окладом, изображен суд св. Иакова над женою, а по сторонам раки представлены другия чудеса Святителя и начертано позолоченными буквами сведение о жизни его. Митра украшена разноцветными камнями.

Прежняя сень снята, и рака стоит открыто на катафалке из белаго камня с двумя уступами. На стене за гробницею в золоченой раме за стеклом, повешен образ св. Иакова, шитый золотом по малиновому бархату; по краям образа вышит тропарь Святителю».

Из книги: [Селецкий Д.С.] Описание Ростовскаго Ставропигиальнаго первокласснаго Спасо-Яковлевскаго-Димитриева монастыря и приписнаго к нему Спасскаго, что на Песках. СПб., 1849. С. 21–22